怀孕三个多月的时候突然腰疼的厉害，可能是因为怀孕期间的各种姿势不正确，导致腰椎和腰肌病变而引起的腰痛症状；也可能是因为怀孕期间出现了先兆流产的症状而引起的腰痛表现；还有可能与泌尿系统的结石或者是感染性疾病有关。需要尽快到医院就诊，检查清楚具体原因。