怀孕两周可以通过药流的方法打掉孩子。在怀孕以后的49天之内可以做药流，两个月之内可以做人流。临床通常首先选择药流的方法，副作用比较小，休息的时间比较短，对身体损害也不是很大，但是有一次流不干净的可能性，如果药流流不干净，需要进一步地做清宫处理；如果担心流不干净，也可以选择做人流或者无痛人流。