孕妇在晚上总是莫名其妙的低烧，考虑可能与内分泌系统的疾病或者是结缔组织系统的疾病有关，比如甲状腺功能亢进或者是类风湿性关节炎等。另外，也有可能是患有一些特殊的感染性疾病引起的，比如结核病。患者需要到医院就诊，监测体温，并且化验甲状腺功能，类风湿因子，抗O，必要时进行结核病的相关检查，明确诊断。