怀孕两个月的时候偶尔有褐色的分泌物，这种情况是一种不正常的表现，如果不及时进行处理，有可能对宝宝的发育造成不良影响。造成这种现象的原因可能是胚胎发育异常，也可能是孕酮水平不足，或者是子宫患有疾病。应当及时到医院的产科就诊，检查清楚具体原因后进行处理。