怀孕40多天的时候发现有褐色的分泌物流出，需要尽快到医院的产科就诊检查清楚具体病情后给予相应的处理。怀孕的女性出现褐色的分泌物流出，一般都提示出现了先兆流产的症状，有可能胚胎发育异常，也有可能孕激素水平不足，具体的原因不同，需要采取不同的措施进行处理。