意外怀孕想要做药物流产，最好是在怀孕7周的时候。如果怀孕时间太短，由于这个时候胚胎比较小，反而有可能会出现流产不全的情况。如果时间太长，由于胚胎组织比较大，也有可能会有宫腔残留。如果想要做药物流产，一定要去正规的医院，在医院里进行流产。做药物流产，一旦发现有大的宫腔残留，可以及时进行清宫。