通常是尿道开口处，或者前尿道，暂时有部分梗阻所导致的。通常早上起来排尿分叉，主要是由于夜间的尿液积存于膀胱内，然后膀胱内的压力大，然后在排出时冲击力量比较大，从而使尿道口的形态，出现暂时性的改变。还有可能在射精后，还有部分的精液存在尿道中，这时阴茎的海绵体充血还没有消失，这样也会导致排尿不畅，同时也会出现尿分叉的现象。