y染色体缺失不能生儿子。正常情况下，女性体内的染色体为xx，男性体内的染色体为xy，男孩和女孩是由男性体内y染色体决定的，因此y染色体缺失不能生男孩，只能生女孩。生男孩和女孩要顺其自然，如果出现y染色体缺失，进行怀孕时要定期到医院进行复诊，否则很可能会产生畸形儿。