y染色体缺失一般不能生儿子。y染色体缺失会影响到精子的生成，经常表现为无精症或少精症，有的患者还会出现性功能障碍的现象，比如早泄，因此Y染色体缺失是不可以生出儿子的。y染色体缺失可能是基因突变引起的，也可能是遗传因素导致的，如果打算要孩子，最好到医院做第3代试管婴儿，这样可以减少胎儿发生畸形。