男性不孕不育检查项目费用在三甲医院基本上也就2000-3000元，但具体还是要看你去的医院的收费情况。一般刚开始是进行精液分析，精液异常的话会检查染色体以及做B超检查生殖系统有没有什么异常情况，建议尽快到医院进行全面检查，查明原因，尽快治疗。