男孩总眨眼眼睛疼可能是出现了结膜炎所导致的，也有可能是出现了细菌的感染所导致的，最好去医院检查一下，而且出现了结膜炎，最好是通过药物的方法来进行调理，出现结膜炎有可能会导致流泪的情况发生，有可能会导致眼屎的增多，尽量保持一个良好的睡眠。