中学生眼睛疼可能是用眼过度导致的。患者可以在医生的指导下使用抗疲劳的眼药水进行治疗，同时要减少近距离看手机或电脑的情况，每次用眼一个小时左右，就需要休息10分钟，并向远方进行眺望，也可以在课间休息的时候做眼保健操。平时要注意用眼卫生，不要用手去揉眼睛，以免导致眼睛不舒服的情况加重。