飞秒激光手术矫正屈光不正，手术中因为使用表面麻醉剂，因此手术中不会疼痛。手术后，表面麻醉剂作用消失，因为手术后角膜组织炎症刺激，可以引起眼睛疼痛，疼痛程度一般是轻度、中度疼痛，都能够忍受，严重的疼痛可以考虑使用普拉洛芬眼药水，口服非甾体抗炎药物吲哚美辛、布洛芬等治疗，飞秒激光属于微创手术，一般一到三天疼痛恢复。