眼睛进了小石子是会自动排出的。因为眼睛的结膜囊本身就有分泌功能，并且会分泌出大量的泪水把小石子冲出来，当然患者也可以使用一些眼药水进行冲洗，如果在出现无法排除的时候，可以到医院里进行检查，让医生取出，这样才可以避免眼睛出现感染，也不会对视力造成伤害。