霉菌进入眼睛会导致感染的，因为手上有细菌，用手揉眼睛造成的。建议初期进入眼内，没有任何症状时，首先需要采取生理盐水冲洗结膜囊，冲洗干净后可以在眼部滴盐酸左氧氟沙星滴眼液治疗，这样可以防止霉菌感染，如果不及时处理，会导致眼红，异物感，疼痛，流泪等不适感。