上颌骨囊肿手术在术前要进行麻醉的，通常是进行全身麻醉，当进行了全身麻醉之后，手术过程中是不会有任何痛苦的，在上颌骨囊肿手术术后的短期会有一定程度的疼痛，如果疼痛特别明显，可以服用止疼的药物，比如布洛芬，芬必得，洛索洛芬钠片等来止疼。通常情况下，上颌骨手术术后一周后疼痛就会逐渐的消失。