扁桃体炎并发症常见的有局部和全身的并发症，如扁桃体周围脓肿、也可能会侵犯到周边的组织引起鼻窦炎、淋巴结炎、鼻窦囊肿等。若扁桃体炎治疗不及时或治疗不彻底，也容易导致病情反复，迁延难愈，演变成慢性扁桃体炎。扁桃体炎引起的全身性并发症有感染性休克、脓毒血症，这些并发症是很可怕的。