跑步后出现耳痛，主要是由于中耳炎、外耳道炎等或某些神经性疼痛引起，患者可以先去医院检查一下，做一次微生物学检查，然后再进行血液检查，如果属于某些由炎症性病变引起的可以用抗生素治疗，如果是某些神经病和其他疾病引起的症状，可以用一些可以滋养神经的药物治疗。