耳穿孔的症状与耳穿孔的因素有关系，也有一些共有的症状。例如捏着鼻子、闭着嘴巴鼓气的时候，耳内有漏风的感觉。外耳道滴药的时候，例如苦味的或者其他味道的药液，会通过咽骨管到咽喉部，会感觉到滴耳液的味道。不同原因引起的穿孔有一些特殊的症状，例如耳外伤引起的，可能出现耳痛、外耳道流血。