皮下囊肿手术时间一般在一个小时左右。如果皮下囊肿有感染的情况，通常会引起发热和头痛，也有少数人群在按压的时候会有刺痛感，要尽快通过切除手术来治疗，手术之后，也要定期的去医院做检查，有效排除是否有病变的现象，引起皮下囊肿，通常有先天性遗传的因素。