阴茎上起水泡可以适当的涂抹一些红霉素软膏来进行治疗，也可以口服一些抗病毒的药物，比如阿昔洛韦，阴茎上起水泡有可能是生殖器疱疹导致的，平时一定要加强局部的卫生清洁，经常换洗内裤，避免过于潮湿。同时尽量不要喝酒，不要吃一些辛辣或者是海鲜之类的食物。