注射hpv疫苗以后扁平疣的病情好了，二者之间一般是没有绝对关系的。虽然扁平疣也是因为感染了人乳头状瘤病毒后引起的一种疾病，但是引起扁平疣的人乳头状瘤病毒和HPv疫苗所预防的人乳头状瘤病毒是不同的亚型。注射了hpv疫苗对扁平疣的病情并没有明显的影响。患者在接种hpv疫苗后扁平疣好了，考虑是由于其他原因使自身免疫功能改善的情况下扁平疣自愈的表现。