宝宝指甲发黄变厚凸起有可能是因为缺乏微量元素或者是缺钙的原因导致的，可以在医生的指导下服用补钙和补铁的药物来进行改善。如果宝宝指甲发育不良或者是出现真菌感染，也有可能会导致发黄和变厚的症状，必要时可以到医院做一个微量元素的检查，明确诊断之后对症治疗。