治疗跖疣的药物主要是一些抗人乳头状瘤病毒的药物和溶解角质的药物，主要是局部外用的药膏。这些外用的药膏大部分都属于非处方药，药店里面应该是有这些药膏的。患者可以先到医院的皮肤科就诊，经过医生的检查，进一步确定具体病情并且制定治疗方案，然后再考虑是否可以在药店拿药。