婴儿乳蛋白过敏的主要症状是皮肤反应，其次是胃肠道反应。皮肤方面主要是表现为湿疹，发病部位主要位于面部、额部、颈部以及前胸和后背，甚至四肢躯干的皮肤，主要以出现的皮疹而且伴有瘙痒。胃肠道反应是乳铁蛋白过敏的另一主要表现，主要表现为腹泻、大便次数增多。