治疗尖锐湿疣的药物比较多，有外用药，局部注射药物，口服药物。外用药物一般是使用咪喹莫特，氟尿嘧啶膏，鬼臼毒素，足叶草脂，干扰素软膏，喷昔洛韦软膏，还有高浓度醋酸。注射药物可以使用白介素，干扰素，聚肌胞，胸腺五肽局部注射或者是肌肉注射，抗病毒治疗。除此之外，还可以使用光动力治疗。或者是局部热疗也是不错的方法。在使用这些药物方法治疗的同时，局部使用一些中药泡洗能够在一定程度上防止疾病的复发。