非淋菌性尿道炎经过正规治疗是可以治愈的，如果治愈以后就不会有后遗症了。由于非淋菌性尿道炎起初的时候症状不明显，会延误治疗的最佳时间，或者经过治疗以后症状很快减轻，被患者忽略停止用药以后很快再次复发，由于反复发作会有后遗症的发生。比如会产生沉重的心理负担，影响正常怀孕生育宝宝等。