磷酸可待因的常见的副作用有心理幻想、呼吸缓慢或不规律、心率异常、耳鸣、震颤，甚至不能自控肌肉运动，有些表现为荨麻疹、皮肤瘙痒、甚至脸肿的过敏反应。如果使用不当还会引起肠胃的不适，也可能会引起口干、便秘、腹泻的症状。长期服用的会有依赖性。会使人体的免疫力下降，对神经系统也有一定的影响。