吃木瓜副作用包括皮肤受到刺激，呼吸道和肠胃道疾病等，对吃木瓜对有过敏反应者，禁忌食用，对精血不足的人群需要慎重使用。有胃寒的人也不适合吃木瓜，吃了木瓜会引起腹胀腹泻等症状，木瓜不可以与海鲜一起食用，会导致头痛引起食物中毒，也不可以和南瓜一起食用，会降低里面的营养成分。