肝素钙和肝素钠大多数在治疗方面和药物成分方面有所区别，这两种药物比较常见，属于一种抗凝药物，前者里面含有多糖物质，主要有羊、牛和猪肠黏膜中提取物质形成药物，用于治疗中度静脉血栓以及高度静脉血栓等疾病。后者属于一种处方药物，常治疗急性深度血栓疾病。