引起肝内钙化灶的原因有很多，其中包括：肝内胆管小结石；肝内局部急慢性炎症、创伤后恢复灶；先天性肝发育畸形及钙化灶；肝内寄生虫感染后包裹钙化；肝内或肝外小肿瘤转移后形成钙化灶；另外，也有文献报告称长期大量补钙肝内可形成钙化灶。如果没有症状且没有其他影像学异常可以先不处理，定期检查。