正常情况下，胃肠道，特别是肠道存在各种类型的细菌，这些细菌相互影响相互制约，共同维持着胃肠道的正常消化功能，如果有特定的致病菌生长过于优势，则会出现病态（最常见症状为腹泻），而益生菌的主要作用就是增加另外一种优势菌来抑制致病菌的生长，而这种益生菌并不会致病，从而达到治疗或保健的作用。