HIV共有两种亚型，即I型和II型，其中最常见的为I型，II型主要非洲分布。这两种亚型只要是有部分基因不同，但是其传染性、病毒的损伤性、机体的防御性等并没有太大的区别，同属于逆转录病毒，治疗和预防的方式也都是一样的。只是有部分标记的不同，需要的检测试剂需要两个标记同步检测。