主要包括组织结构和肿瘤结构，另外还包括来源于正常组织不同程度的差异。良性肿瘤的异型性通常不明显，但是排列与正常组织是不一样的，比如子宫平滑肌瘤。恶性肿瘤的组织结构异型是比较明显的，癌细胞排列更为混乱，会失去正常的排列结构以及层次和极向，比如纤维肉瘤和腺癌等。