黑苦荞胚芽茶的副作用有可能会对胃肠道产生刺激，出现恶心、呕吐、腹痛以及腹胀等现象，如果是偏寒体质或者患有胃炎的话，喝黑苦荞胚芽茶，可能会出现反酸、胃胀和消化不良的现象。黑苦荞胚芽茶具有活血化瘀、清热解毒以及生津止渴的作用，还具有健脾胃和美容养颜的效果，适当的喝还能够降低血液中的胆固醇，达到降血糖的作用。