甲氨蝶呤的副作用一般情况下在三天之内会逐渐消失，由于每个患者的体质不同病情的严重不同，出现的副作用也会有所不同，所以副作用具体消失的时间也会有所差异。患者在服用甲氨蝶呤的药物后，可能会出现头晕、恶心、呕吐、身体乏力等不良反应，一旦有副作用出现，一定要立即停药，并且及时去正规医院就诊。