两种药品的区别较小，最好是根据自己的病情在医生指导下选择合适的用药。多潘立酮对于上腹部闷感以及腹胀和恶心有较好的治疗效果，另外还可以治疗有反流物造成的胃部有灼热感，也有较好的治疗作用。莫沙必利主要用于治疗消化功能不良所导致的胃部有灼热感以及恶心和呕吐的情况。