这两种药物都是治疗痔疮的药物，治疗病征和药物效果是有一定的区别，应该是要根据自己的自身情况来合理使用。肛泰软膏能起到改善便血、肿胀和疼痛等表现的作用，马应龙痔疮膏能改善外痔或是肛裂而引起的肿胀和疼痛等，可清热燥湿，能活血，并能去掉腐肉。所以每个患者病情不同，选用不同药物，疗效也是不一样的。