长期吃阿托伐他汀钙片的危害是肝功能损害或者肌肉疼痛等等。1、肝功能损害主要表现出转氨酶的上升，可以在服用3个月左右，就能出现。2、肌肉疼痛：患者可以在服药之后，会出现肌肉疼痛或者横纹肌的溶解等等，所以患者需要及时就医，积极的检查之后，可以用药物进行治疗。但是治疗期间，需要停止服用此药，否则会加重病情。