青霉胺主要的不良反应有胃肠道症状，容易出现恶心呕吐以及厌食。另外还可能会出现味觉异常，有口腔溃疡的表现。患者在使用青霉胺之后容易会导致血液系统的副作用，会出现白细胞减少，粒细胞减少，也有一部分的患者容易会有再生障碍性贫血，所以随时都应该监测血象，还应该监测肾功能。