泮托拉唑肠溶胶囊可能会有的副作用主要包括：1、有可能会引起过敏反应，导致起皮疹和皮肤瘙痒的症状。2、有可能会引起中枢神经系统症状，出现头晕、入睡困难、或者嗜睡的表现。3、有可能会引起便秘或者腹泻的症状，有可能会出现恶心的反应。如果出现各种不良反应，需要到医院复诊。