活血止痛胶囊的副作用较多，可能会引起恶心呕吐等一些肠道不适的症状。也可能会导致胃部不适，由于个人体质存在差异，所以在使用这种药物之后皮肤上也可能会出现丘疹等过敏反应。另外长期的使用这种药物也可能会引起胃溃疡。如果出现用药副作用时，要立即停药并且及时到医院咨询专业医生。