金刚藤胶囊的副作用是比较轻微的，有些患者可能会出现胃肠道的不适，比如说恶心，还有呕吐等问题，而一般停药之后可以自行缓解。但是应该要注意的是，孕妇应该要禁止服用该药物。另外在使用药物的过程中，应该要饮食清淡，要避免食用一些生冷，还有辛辣刺激的食物，如果是哺乳期的女性，也要慎重使用。