卡介苗多糖核酸的危害是很轻的。很多患者用药后会出现用药部位发红发肿的情形，有些患者也会出现体温过低的症状，极其少的患者会出现过敏性休克的情形。某些患者在用药后会出现免疫力下降的情形。在用药之前，患者一定要咨询医生，避免造成不良反应。在用药之后，患者最好不要吃过于辣的东西，像辣椒和生姜等。