通便灵胶囊最主要的副作用，就是有可能引起药物性的腹泻。这种药物本身就是一种治疗便秘症状的药物，服用以后会出现不同程度的拉肚子现象。不过，正常情况下，在停止服药后，腹泻的症状就会自行缓解、消失。但是如果服用剂量过大或者是体质比较特殊，有可能在停药后腹泻症状不能自行停止。