用来治疗泌尿系统感染的药物较多，主要是根据具体的病因来决定。大部分是由于细菌感染所致，所以建议采取杀菌消炎的药物进行治疗，比较常见的有β内酰胺类、大环内脂类、喹诺酮类等。而病毒性、真菌性的泌尿系统感染则需要抗病毒、抗真菌相关药物治疗。另外还有一些中成药物具有清热解毒、利湿通淋的作用，有利于炎症的吸收。