通常是由于遗传因素所导致的，如果有幽门肌肥厚的家族史，子女的患病率会比普通人要高。有可能是体内的肽能神经出现了结构明显改变或者是有功能不全所造成的，如果胃肠道受到了明显的刺激会使胃液里面的胃肠激素出现明显的升高，造成幽门肌肉持续紧张。患者需要到医院去做幽门的B超还有钡餐检查来对病因进行诊断。