酪酸梭菌活菌散新生儿一般可以吃，但是在让新生儿吃药时一定要注意药物的剂量，小剂量的吃药不会给孩子带来影响。酪酸梭菌活菌散用来治疗肠道菌群失调，如果新生儿出现消化不良的症状，可以在医生的指导下使用酪酸梭菌活菌散来治疗，治疗期间要避免与其他的抗生素一起服用。