宝宝发烧39度，一直烧一晚上的话，确实可能会使得脑部造成一定的损伤。对宝宝来说，39度已经属于高烧了，此时就应该引起高度的重视，可考虑在医生的指导下，适当的给宝宝服用一些具有退烧效果的药物，另外最好是同时配合以物理降温，比如说给宝宝进行温水擦浴，或者是使用冷毛巾给宝宝敷额头。