疱疹性咽峡炎可以在医生的指导下使用抗病毒的药物来进行治疗，比如抗病毒口服液、银黄颗粒等。其次需要针对疱疹性咽峡炎所引起的症状进行对症处理，如果出现喉咙疼痛的症状，可以使用口腔炎喷剂来缓解症状，如果体温超过38.5度，可以通过服用布洛芬颗粒等退热药物进行降温治疗。